Самый простой способ конвертировать диск с FAT32 в NTFS – это воспользоваться командой CONVERT том: /FS:NTFS [/V]. Преобразование выбранного диска будет после перезагрузки ОС.

Но, в этом случае важно знать тот факт, что после конвертации размер кластеров выбранного диска будет 512 байт. А это не очень хорошо для больших разделов. Кроме этого после конвертации через команду CONVERT жесткий диск будет очень сильно фрагментирован. Обратная конвертация через команду CONVERT не возможна.

Одной из самых лучших программ для преобразования FAT32 в NTFS, является  Partition Magic. Я, рекомендую использовать версию не ниже 6.0 т.к. в ней наилучшим образом реализовано быстродействие и качество выполнения конвертации без потерь и фрагментации. Partition Magic работает с основными разделами и не работает с динамическими дисками.

Лично в моей практике я только один раз пользовался командой CONVERT. Только после этого пришлось дифрагментировать диск, чтобы увеличить быстродействие.